连云港本地所有的本科大学名单为江苏海洋大学、南京医科大学康达学院。

| 序号 | 学校名称 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 1 | 江苏海洋大学 | 江苏省 | 连云港市 | 本科 | |
| 2 | 南京医科大学康达学院 | 江苏省教育厅 | 连云港市 | 本科 | 民办 |
江苏海洋大学是江苏省属全日制普通本科高校。学校前身是1985年创办的淮海大学(筹),1989年教育部批复为淮海工学院。1998年至2002年,均具有40年以上办学历史的原江苏盐业学校、连云港水产学校和连云港化工高等专科学校先后并入淮海工学院。2019年6月,教育部批准学校更名为江苏海洋大学。海洋高等教育办学历史可追溯至始建于1958年的新海连水产专科学校(后更名为连云港水产学校)。2013年8月,国务院学位委员会批准学校为硕士学位授予单位。2017年7月,学校成为博士学位授予立项建设单位。
学校位于“一带一路”交汇点建设的核心区先导区、亚欧大陆桥东桥头堡、全国首批沿海开放城市连云港市。现有苍梧校区、通灌校区、宋跳校区和墟沟校区四个校区,主校区(苍梧校区)坐落在国家5A级风景名胜区、《西游记》文化发源地花果山西麓,总占地2193.83亩,校舍面积64.25万方米。现有教职工1600余人,全日制本科生20000余名、研究生1600余名。学校设有20个学院,开设70个本科专业,覆盖工学、理学、管理学、文学、农学、法学、经济学、艺术学、教育学和医学等十个学科门类。
南京医科大学康达学院创建于1999年,是由南京医科大学自主创办并经省教育厅批准的公有民办二级学院。2005年,经教育部批准设立为独立学院。2011年,南京医科大学和连云港市政府签署合作办学协议。2013年9月,南京医科大学康达学院正式从南京迁址连云港办学。
学院设有基础医学部、临床医学部、护理学部、药学部、康复医学部、人文管理学部等12个教学机构,拥有一批在国内外享有盛誉的专业带头人;现已建有30所临床医学院、附属医院和教学医院,同时共享南京医科大学25所附属医院的教学资源。学院现有专兼职教师1814人,其中副高以上职称749人;自有教职工357人,具有博士、硕士学位的教师占85%以上。
学院设有临床医学、预防医学、药学、医学影像技术、护理学、公共事业管理、康复治疗学、医学检验技术等17个专业21个方向。目前学院在校生人数9650人。学院各项教学、实验及生活设施先进齐全。图书馆文献收藏量95万册,同时作为南京医科大学图书馆的分馆,学院学生可以共享南京医科大学图书馆丰富的馆藏资源。
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